1981年8月新疆生产建设兵团图木休克垦区人民法院成立，隶属喀什地区中级人民法院管辖。1984年划归农三师中级人民法院管辖。2003年，随着图木舒克市的成立，图木舒克市人民法院开始组建。2006年3月15日，由最高人民法院批准，设立图木舒克市人民法院，与新疆生产建设兵团图木休克垦区人民法院同一机构两块牌子。

图木舒克市人民法院位于新疆生产建设兵团第三师图木舒克市，地处叶尔羌河下游，是喀什、阿克苏、克州、和田四地州中心地带，管辖五团一处、一个工建集团和五个监狱，以及数个营级单位，辖区面积1901平方公里，辖区人口16万人，共有少数民族11万多人，少数民族人口占68.7%以上，呈现出点多、线长、面广、高度分散的特点。

图木舒克市人民法院政法编制38名，实有干警37名。其中：汉族25人、维吾尔族11人、藏族1人；员额法官13人。 全院设有政治部（含法警大队）、办公室、综合审判庭（含民事审判、刑事审判、行政审判、诉裁和图木休克人民法庭）、立案庭（诉讼服务中心）、执行局等5个内设机构，行使县一级人民法院职权，主要职责为审理法律规定和中级法院指定管辖的刑事、民事、行政等一审案件，依法行使司法执行权和司法决定权，开展法制宣传、提出司法建议等。